Assieme all'aeroporto di Milano-Linate e all'aeroporto di Milano-Orio al Serio forma il sistema aeroportuale milanese con oltre 33 milioni di passeggeri annui (2009).
I primi due scali sono gestiti dalla Società Esercizi Aeroportuali (SEA), Orio al Serio invece è gestito dalla SACBO di cui SEA è il maggiore azionista.
Occupa porzioni del territorio dei comuni di Cardano al Campo, Somma Lombardo, Casorate Sempione, Ferno, Lonate Pozzolo, Samarate e Vizzola Ticino, tutti afferenti alla provincia di Varese, prendendo il nome dalla vicina località di Malpensa, frazione di Somma Lombardo.